מרכז האפילפסיה מעניק שירות לילדים ומבוגרים הסובלים מהתקפים אפילפטיים, משלב האבחון הראשוני ועד להערכה וטיפול בחולים עם אפילפסיה שאינה מגיבה לתרופות (כולל באמצעות טיפול כירורגי לחולים המתאימים).
מטרת הטיפול היא למנוע את התקפים האפילפטיים תוך שמירה על רמת תפקוד ובריאות כללית מרבית. לשם כך ניתנת תשומת לב מיוחדת לכלל הבעיות והצרכים של המטופל/ת. כך למשל הטיפול באפילפסיה בילדים ניתן בהתחשב בצרכים של גיל בית-ספר, ומתחשב בנשים בגיל הפוריות, קשישים המקבלים מגוון תרופות אחרות וכו'.
מרכז האפילפסיה בהדסה מציע שירותים מגוונים לחולים אמבולטוריים ולחולים מאושפזים, הניתנים ע"י צוות המרכז ובשיתוף המחלקות לנוירולוגיה ונוירוכירורגיה, היחידה לנוירולוגית ילדים ובשיתוף הדוק עם מחלקות ושירותים נוספים של בית החולים.
במסגרת מרכז האפילפסיה בהדסה מתבצע מחקר לקידום הידע וההבנה על מחלות מוח בכלל ועל אפילפסיה בפרט, כמו גם על התפקוד התקין של המוח האנושי. בנוסף מתבצעים ניסויים קליניים הבוחנים יעילות של שיטות אבחון וגישות טיפול חדשות. ההשתתפות בניסויים קליניים הינה אך ורק בהסכמה מלאה של המטופל.