מרפאת אף-אוזן-גרון בעין כרם נמצאת בקומה 3 של הבניין הראשי ומשותפת למבוגרים וילדים. במידה ויש צורך לאשפז ילד לצורך ניתוח או השגחה הוא יאושפז לרוב במחלקת כירורגית ילדים בעין כרם.
ילדים עם בעיות הקשורות לאף-אוזן-גרון מטופלים בהדסה במחלקת ילדים, במחלקת כירורגיה ילדים או במרפאות.
בתוך היחידה לאף אוזן גרון בהדסה עין כרם נמצא המכון לאודיולוגיה והפרעות בתקשורת המורכב מקלינאי תקשורת מנוסים. במידה וישנו צורך, יפנה הרופא את המטופל לטיפול במכון לאודיולוגיה.
רפואת אף-אוזן-גרון בהר הצופים נמצאת בקומה 2 בבניין מאיר (בניין המרפאות החדש) ומשותפת למבוגרים וילדים. במידה ויש צורך לאשפז ילד לצורך ניתוח או השגחה הוא יאושפז באחת ממחלקות הילדים בהר הצופים.